設定アプリケーションを起動すると、「HHKB Lite2 for Mac 4.0: 140.0094, -536870203, 」というエラーメッセージが表示されて動作しません。
これは、Krabiner-Elementsがインストールされた環境で発生します。
Macドライバーは、Krabiner-Elementsとの共存はできません。
アプリケーションフォルダにあるKrabiner-Elementsを起動して、DevicesタブにあるHHKBキーボード（PFU-xx USB Keyboard）の"Modify events from this device"のチェックを外してください。
あるいは、Karabinerのアンインストールをお願いいたします。
「ドライバがインストールされていますが、読み込まれていません。」というメッセージが表示される場合には、キーボードのUSBコネクタの抜き差しをお試しください。
対応ツールを公開しておりますので、ダウンロードしてインストールしてください。