キーマップ変更ツールで設定したプロファイルとは異なるプロファイルが、
選択されている可能性があります。
HHKB Studioでは、キーレイアウトをカスタマイズしたプロファイルを、
本体の「1」~「4」の数字キーに4つまで保存できます。
以下の手順でプロファイルを選択ください。
1)
「Fn」キーを押しながら
「C」キーを押します。

プロファイル変更モードに移行し、現在のプロファイル番号(Profile1~Profile4)に
対応する位置のLEDインジケーターが白色で点滅します。
例えば、Profile1を使用している場合は、最も左のLEDインジケーターが点滅します。
※プロファイル変更モードを解除したい場合は、「Fn」+「X」キーを押してください。
2) 使用したいプロファイル番号の数字キー(「1」~「4」のいずれか)を押します。

切り替え先のプロファイル番号(Profile1~Profile4)に対応する位置の
LEDインジケーターが白色で点灯します。
例えば、「2」キー(Profile2)を押した場合は、左から2番目のLEDインジケーターが
点灯します。
プロファイルの切り替えが完了すると、LEDインジケーターが消灯します。
※キーボードの電源をONにすると、自動的に前回使用したプロファイルが適用されます。
※キーマップ変更ツールにて、Profile1の配列を設定した場合は「Fn」+「C」+「1」となります。