以下の原因が考えられます。
給紙面を確認し、「白紙ページを自動的に削除する」のチェックを外して、再度スキャンしてください。
※iX1300 / iX110 / iX100の場合は表面を上に、そのほかの機種は表面を下にして読み込ませてください。